SEFAC nace oficialmente el 21 de diciembre de 2000, fecha en la que es inscrita en el Registro Nacional de Asociaciones del Ministerio de Industria, en Madrid, y en la que el colectivo de los farmacéuticos comunitarios deja de ser el único en España sin su propia sociedad científica y profesional. Pero la historia de SEFAC comienza un año antes, en el I Congreso Nacional de Atención Farmacéutica, en San Sebastián. Allí fue donde Francisco (Paco) Martínez Romero (1951-2016), sorprendido de que congreso farmacéutico tras congreso farmacéutico nunca encontraba comunicaciones presentadas por farmacéuticos comunitarios, empezó a ver clara una idea que ya venía rumiando desde tiempo atrás, y que poco después, con el apoyo de unos cuantos compañeros de distintos puntos de España, moldeó en un hotel de Madrid el 27 de julio de 2000. En tiempo récord redactaron unos Estatutos y SEFAC se presentó en sociedad el 21 de marzo de 2001 en la Real Academia Nacional de Farmacia con la bendición del entonces director general de Farmacia del Ministerio de Sanidad, Federico Plaza, y tras una primera Asamblea General celebrada ese mismo día en la que se ratificaron esos primeros Estatutos y se dio oficialidad a la primera Junta Directiva.
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